其不同之处主要有6点。
(1)适用范围不同：
    ISO14000系列标准适用于各种类型的组织，HSE只适用于石油天然气工业部门；
(2)标准的服务点不同：
    ISO14000系列标准针对组织活动、产品和服务的环境影响，而HSE的服务点在于石油企业的健康、安全与环境管理；
(3)标准的级别不同：
    健康，安全与环境管理体系标准尚由ISO正式发布，只是国际石油界普遍认同，HSE仅为石油天然气行业标准；
(4)要素的内容有一定差别:
    ISO14001由环境方针、环境规划、实施与运行、检查和纠正措施及管理评审五个基本要素构成；HSE由领导和承诺、方针和战略目标、组织结构、资源和文件、评价和风险管理、规划、实施和监测及审核和评审七个要素构成；
(5)结构不对应:
    ISO14000系列标准中规定的环境管理体系基本结构为：准备——初始环境评价——环境方针——环境计划——环境管理体系的实施(包括组织机构、配备资源、人员培训、信息交流、运行控制、应急准备和响应等内容)——环境管理体系文件——环境表现的测量和评价——评审和改进。HSE的基本结构为：最高管理者的领导和承诺——制定方针和战略目标——建立机构、配备资源、进行文件管理——对健康、安全与环境表现进行评价，确定风险并加以管理——规划——实施和监测——审核、评审并持续改进；
(6)隶属关系可能不同；
    质量管理体系由质量部门管理，环境管理体系由环保部门管理，而健康、安全与环境管理体系由安全、工业卫生、环保部门共同管理。